自 1877 — 1949 年间，重庆基督教的教堂有 91 座，其中由重庆人创建的教堂 10 座。另有如基督教青年会等综合性宗教社团 36 个。
   抗战时期，重庆基督徒积极投入抗日救亡运动。 1938 年成立了“重庆红十字救护委员会”，开赴前线第九战区（江西）进行救护工作。这期间， 1941 年由贾玉铭牧师在南京创办的中国基督教灵修学院迁入重庆，院址在黄桷垭文峰段 40 号，称“重庆灵修学院”； 1946 年由陈崇桂牧师在四川宜宾创办的神学院迁入重庆，在渝中区放牛巷 50 号，称“重庆神学院”。
    1950 年，重庆基督教积极响应 “ 三自 ” 革新运动，于 1952 年 12 月正式成立了重庆市基督教三自革新运动委员会（后改称三自爱国会）。 1958 年全市各教派实行联合礼拜后，走上了“三自爱国”的办教道路。
    1979 年，宗教信仰自由政策逐步得到落实，重庆市基督教爱国会恢复工作，同年 12 月 24 日 ，渝中区社交会堂（现更名为：圣爱堂）率先恢复崇拜活动，相继各地教会的活动得以正常开展起来。
    1998 年，重庆直辖市以后，成立了重庆市基督教三自爱国运动委员会、重庆市基督教协会。目前全市基督教信徒已逾 50 万，开放堂点 100 多处，有教牧人员 80 多人，其中牧师 40 多人，长老 8 人。
    目前，全体教牧同工正以时代的呼声，坚持三自原则，加强神学思想建设，用纯正的信仰带领广大信徒，爱国爱教，在构建和谐社会中见证基督的真理，实践耶稣对门徒作光作盐的教训，一个充满基督恩典的教会正在重庆这片热土上兴旺。